440~443話中，與四代目火影見面之後，鳴人才知道自己是四代目的兒子，情緒激動。四代目相信鳴人一定能夠守護木葉，幫鳴人把封印修復，九尾瞬間消失。鳴人變回了仙人模式後，巧妙利用天道佩恩神羅天征5秒的發動時間隔，在時間隔內用螺旋丸將其擊敗。之後鳴人獨自追蹤長門的真身，半路謝絕了山中亥一一行人的援助，鳴人終於到達長門真身的所在地。
448~449話中，鳴人與長門一番對話後，長門被其永不放棄的意志所打動，決心將促成和平的願望交付鳴人。長門使用‘外道·輪迴天 生之術’令木葉所有死亡者復活(自來也的屍體在超越人體幾倍的水壓下，無法復活)，但相反卻犧牲了自己的性命。小南把長門及彌彥的遺體帶走，同樣把希望託付給鳴人。鳴人決意繼承師父(自來也)及兩位師兄(長門和彌彥)的遺願……
514話中，鳴人在仙人模式下解除了兜的束縛，並且輕鬆打倒克隆“半尾獸化(四尾)”下的“鳴人”。
673話，鳴人接受六道仙人賦予的力量，成功地開啟了六道仙人模式，身後出現了求道玉，手中出現了黑棒，能使用所有尾獸之力並且學會了陰陽遁。
